在毛細管離子色譜中，色譜柱尺寸、樣品進樣體積以及流動相流速均下降了10-100倍。除此之外，毛細管離子色譜系統(tǒng)還可以持續(xù)運轉，一直處于準備狀態(tài)等待分析樣品。由于每天的水消耗量只有15mL，轉換成一年也才只有5.2L，所以這種連續(xù)的操作模式是可行的。